Известно време бях забравил за този въпрос, но сега отново ми се наложи да използвам серийния порт. Потърсих из нета и намерих една на пръв поглед много удобна С++ библиотека за управление на серийния порт
libSerial.
Ако някой се интересува или има същите намерения да програмира серийния порт мисля че тази библиотека би била от полза.