Edit > Preferences > General > Text Subtitles (слагаш отметка на) Load subtitle files when movie is loaded. Също така може да сложиш на Encoding: да е Cyrillic (Windows-1251)
Става и от View > subtitles > Select Text Subtitles
Инсталираш от хранилището Medibuntu следния пакет - w32codecs или w64codecs. След това отваряш файловете с SMplayer и би трябвало да няма проблем. За повече информация: https://help.ubuntu.com/community/Medibuntu