Титла: Линукс и R скриптове Публикувано от: kuunlaaksot в Feb 26, 2024, 16:07 Здравейте, гледам тука различни езици са зачекнати, та ми е интересно някой за нимава ли се или се е занимавал с R? В случай, че "да", някакви препоръки за дистрибуция, която идва с много R модули?
Титла: Re: Линукс и R скриптове Публикувано от: ddantgwyn в Feb 27, 2024, 20:14 Здравейте, гледам тука различни езици са зачекнати, та ми е интересно някой за нимава ли се или се е занимавал с R? В случай, че "да", някакви препоръки за дистрибуция, която идва с много R модули? Хм, доколкото знам трябва да го има в повечето дистрибуции, но за модули не съм проверявал. Какво точно ти трябва? R беше специфичен език, доколкото помня, за статистика. Титла: Re: Линукс и R скриптове Публикувано от: kuunlaaksot в Feb 27, 2024, 20:49 да, R го има за повечето дистрибуции, дори CRUX идва с порт за него в contrib хранилището.
Знам за Debian и оттам Ubuntu, че имат модули. Да речем Seurat от CRAN. А иначе, R отдавна не се използва само в статистиката, като цяло се ползва за обработка на (всякакви) данни. Примерът по горе е за анализ на single cell / spatial transcriptomics, нещо специфично за биологията, и на мене такива модули ми трябват. Мисля, че Arch Linux имат богато хранилище, но дистрото не ми е точно по вкуса... ако не беше пустият systemd може би щях да му дам шанс пак. Титла: Re: Линукс и R скриптове Публикувано от: ddantgwyn в Feb 27, 2024, 21:22 да, R го има за повечето дистрибуции, дори CRUX идва с порт за него в contrib хранилището. Имам усещането, че не трябва да търсиш модули в дистрибуциите, все пак те ти дават някаква основа, на която да надграждаш каквото ти трябва. На първо четене ми излезе това - R for Biologists ($2), предполагам, че ти е известно. Може би ще трябва да търсиш специализирани сайтове за модули за R, а не да се чудиш коя дистрибуция да използваш (imho). Титла: Re: Линукс и R скриптове Публикувано от: kuunlaaksot в Feb 27, 2024, 21:36 е, модули се инсталират от самия Р, подобно на Perl с неговия CPAN. Аз за момента си имам решение, просто ми беше интересно за другите дистрибуции ако някой има поглед. А и реших да взема да задам в сайта за линукс въпрос свързан линукс, ей така, за разбообразие...
а това дето си пратил, не ми бепе известно, но е доста рудиментарно Титла: Re: Линукс и R скриптове Публикувано от: 4096bits в Feb 27, 2024, 22:14 е, модули се инсталират от самия Р, подобно на Perl с неговия CPAN. Аз за момента си имам решение, просто ми беше интересно за другите дистрибуции ако някой има поглед. А и реших да взема да задам в сайта за линукс въпрос свързан линукс, ей така, за разбообразие...Последния провал на Google нали го знаете. С ИИ-то им, което отказва да генерира картинки на бели хора. Титла: Re: Линукс и R скриптове Публикувано от: kuunlaaksot в Feb 27, 2024, 22:19 мисля, че нещо обърка темите... :P
Титла: Re: Линукс и R скриптове Публикувано от: ddantgwyn в Feb 27, 2024, 22:48 е, модули се инсталират от самия Р, подобно на Perl с неговия CPAN. Аз за момента си имам решение, просто ми беше интересно за другите дистрибуции ако някой има поглед. А и реших да взема да задам в сайта за линукс въпрос свързан линукс, ей така, за разбообразие... Ами R имат CRAN :) Просто нямам идея какво точно ти трябва, за това съм и толкова неконкретен. А и защото не ползвам R в момента, щях да го ползвам, ако бях останал инженер :) Мисълта ми беше, че надали в дистрибуциите ще се ангажират да доставят много модули за R, по-скоро ще трябва ти да си ги намираш и инсталираш. Титла: Re: Линукс и R скриптове Публикувано от: kuunlaaksot в Feb 28, 2024, 13:48 Цитат Мисълта ми беше, че надали в дистрибуциите ще се ангажират да доставят много модули за R, по-скоро ще трябва ти да си ги намираш и инсталираш. а, аз съм си намерил решение -- написах си туулче да ми генерира портове за модули от CRAN и BioRender, бетер със зависимостите. Та всичко е на 6. Като искаш нещо да стане като хората, направи го сам. В момента имам към 400 такива порта, та си играя на пакетен мейнтейнър, въпросът е че тая идилия не съм сигурен колко време ще продължи, та се оглеждам. ;) А причината, че искам модулите да са част от пакетната система на дистрото, е че понякога зависят от нещо извън R. И ако има промяна в такава зависимост, бидейки инсталирани извън пакетната система, инструменти като revdep няма да хванат проблема. Примерно, ъпдейтнаха libxml2, и един (вече нев помня кой) модул се строши, ама го разбрах баш когато се опитах да го заредя заради някакъв скрипт. И преди да чуя съвета "ползвай дистро дето не прави такива неща" -- Slackware направи същата простотия за стабилния си клон, та сума ти хора от SlackBuilds.org пропищяха с чупещи се пакети дето зависят на libxml2. както и да е, беше ми приятно да си полафя за Линукс Титла: Re: Линукс и R скриптове Публикувано от: ddantgwyn в Feb 28, 2024, 19:22
[_]3 Титла: Re: Линукс и R скриптове Публикувано от: 4096bits в Feb 29, 2024, 00:13 мисля, че нещо обърка темите... :PДа, форумчето понякога прави това. При логване си на друго място |