Не се монтират дискове, а се монтират дяловете (и, по-точно, файловите им системи), които имаш в тях. За да монтираш някой дял, трябва първо да добавиш partition таблица, да създадеш дяла и да му дадеш файлова система. Явно по време на инсталацията на системата си указал дялове и форматиране само на първия диск, но не и на втория, и сега вторият ти диск е празен и трябва да го настроиш за ползване.
Ако ще използваш само физически (стандартни) дялове, инструментът gparted (графичен е) ще ти е достатъчен за добавянето на partition таблицата (ползвай тип msdos), създаването на дяла (дяловете) и форматирането. Ако ще ползваш LVM, ще ти е полезен инструментът system-config-lvm (и той е графичен), с който да нагласиш логическите групи и томове.
След като създадеш дяла и го форматираш с избраната ти файлова система, вече ще е готов за ползване. Можеш да го монтираш с командата
sudo mount -t ФС /dev/sdX /media/ПАПКА
където ФС е типът на файловата система, /dev/sdX e името на устройството (например, /dev/sdb1), а /media/ПАПКА е папката, в която да се монтира (трябва да я създадеш предварително). След като монтираш дяла, можеш да изпълниш командата
cat /etc/mtab
при което ще ти се покажат текущо монтираните файлови системи, намираш реда за твоя дял и го добавяш в /etc/fstab, за да се монтира дялът автоматично със зареждане на операционната система.
От няколко версии насам Ubuntu (а и други дистрибуции) имат готови инструменти за монтиране и демонтиране на дялове графично от потребителя. Ако нямаш нужда вторият диск да седи постоянно монтиран, след като го форматираш можеш да пропуснеш стъпката с добавянето му в /etc/fstab и просто да рестартираш системата. След като системата зареди ще видиш иконка за дяла ти в левия панел с икони на Unity. Цъкаш на него, пишеш си паролата и ще се монтира.
Относно битовете на системата, щом машината ти е 64-битова, то ти препоръчвам да си ползваш 64-битова система на нея, за да се възползваш максимално от възможностите ѝ. Не е задължително, може и 32-битова, ако някога намериш някакви съображения, заради които да го искаш, но по-добре е 64-битова. Във виртуалните машини препоръката е същата. А за проблема с мишката във вртуалката, трябва да кажеш какъв софтуер за виртуалки ползваш и малко по-подробно описание на проблема.