намираш grub.conf  и го настройваш както то е удобно.
не е никак сложно.
grub.conf се намира в /boot/grub за RH i FC, за другите дистрибуции не съм сигурен за местоположението

Аз имам същата инсталация - FC3 и WinXP, но GRUB  е инсталиран в MBR и всичко работи добре. Първо инсталирах windows , после FC3. GRUB е в MBR и указах Windows да се стартира по подразбиране. На диска си имам повече дялове, но това не пречи. Решението на задачката е GRUB да е инсталиран в MBR.
Надявам се да съм помогнал. '>