Linux за българи: Форуми

GeSHi (C):
                              Quantitation Report    (Not Reviewed)
 
  Data Path : C:\DATA\Verefication\
  Data File : Z38961-18-500mg-s05.D                               
  Acq On    : 25 Aug 2015   6:26
  Operator  : ya
  Sample    : Z38961-18-500mg-s05
  Misc      :  
  ALS Vial  : 7   Sample Multiplier: 1
 
  Quant Time: Aug 26 18:59:13 2015
  Quant Method : C:\DATA\Verefication\Ver.Calc.M
  Quant Title  : 1
  QLast Update : Tue Aug 25 17:09:53 2015
  Response via : Initial Calibration
 
          Compound                   R.T. QIon  Response  Conc Units Dev(Min)
   --------------------------------------------------------------------------
 
   Target Compounds                                                   Qvalue
     1) n-Dodecane                  8.610   57 36468494   432.04 mg/l      99
     2) Carbaryl                   15.419  144 42552907   447.79 mg/l      99
     3) Alpha HCH                  19.430  181 31385167   454.65 mg/l      96
     4) Pirimiphos-ethyl           25.967  318 34752599   464.35 mg/l     100
     5) Hexaconazole               28.510   83 36441476   447.38 mg/l      98
     6) PCB 194                    32.516  394 47141857   465.55 mg/l     100
     7) Cyhalothrin I (lambda)     35.211  181 20942983   509.91 mg/l      99
     8) Cyhalothrin II (lambda)    35.562  181 18779375   505.64 mg/l      99
     9) Di-n-octyl phthalate       37.555  149 121057699   430.25 mg/l     100
   --------------------------------------------------------------------------
 
   (#) = qualifier out of range (m) = manual integration (+) = signals summed
 
Ver.Calc.M Wed Aug 26 18:59:13 2015

GeSHi (C):
 
Orig_report                                                                                                     target_compound     rt       QIon      Response    Conc     Units      line    sample      date    time    is_data
---------------------------------------------------------------------------------------------------------- + --------------------- + ----- + ------ + ----------- + ------ + ------- + ----- + --------- + ----- + ---- + ------- +
                              Quantitation Report    (Not Reviewed)                                                                                                                                   
 
  Data Path : C:\DATA\Verefication\                                                                                                                                   
  Data File : Z38961-18-500mg-s05.D                                                                                                                                                                  
  Acq On    : 25 Aug 2015   6:26                                                                                                                                   
  Operator  : ya                                                                                                                                   
  Sample    : Z38961-18-500mg-s05                                                                                                                                   
  Misc      :                                                                                                                                     
  ALS Vial  : 7   Sample Multiplier: 1                                                                                                                                   
 
  Quant Time: Aug 26 18:59:13 2015                                                                                                                                   
  Quant Method : C:\DATA\Verefication\Ver.Calc.M                                                                                                                                  
  Quant Title  : 1
  QLast Update : Tue Aug 25 17:09:53 2015
  Response via : Initial Calibration
 
          Compound                   R.T. QIon  Response  Conc Units Dev(Min)
   --------------------------------------------------------------------------
 
   Target Compounds                                                   Qvalue
     1) n-Dodecane                  8.610   57 36468494   432.04 mg/l      99               
     2) Carbaryl                   15.419  144 42552907   447.79 mg/l      99                
     3) Alpha HCH                  19.430  181 31385167   454.65 mg/l      96              
     4) Pirimiphos-ethyl           25.967  318 34752599   464.35 mg/l     100
     5) Hexaconazole               28.510   83 36441476   447.38 mg/l      98
     6) PCB 194                    32.516  394 47141857   465.55 mg/l     100
     7) Cyhalothrin I (lambda)     35.211  181 20942983   509.91 mg/l      99
     8) Cyhalothrin II (lambda)    35.562  181 18779375   505.64 mg/l      99
     9) Di-n-octyl phthalate       37.555  149 121057699   430.25 mg/l     100
   --------------------------------------------------------------------------
 
   (#) = qualifier out of range (m) = manual integration (+) = signals summed
 
Ver.Calc.M Wed Aug 26 18:59:13 2015

GeSHi (Bash):
for i in $(find . -type f|cut -d '/' - -f2); do cp $i/data.txt $i.txt ; done
for i in $(find . -type f); do sed -i '30,34d' $i; done
for i in $(find . -type f); do sed -i '1,20d' $i; done

GeSHi (Bash):
for i in $(find . -type f); do sed -i 's/PCB 194/PCB_194/g' $i; done

GeSHi (Bash):
for i in $(find . -type f); do rename 's/0mg/0-mg/' $i; done

GeSHi (Bash):
for i in $(find . -type f); do awk -v OFS="\t" '$1=$1' $i > tab/$i; done

GeSHi (Bash):
for i in *.txt
do
	for k in `seq 1 9`
	do
		order=$(sed -n "${k}p" $i | cut - -f1)
		name=$(sed -n "${k}p" $i | cut - -f2) 
		rt=$(sed -n "${k}p" $i | cut - -f3)
		res=$(sed -n "${k}p" $i | cut - -f5)
		rtS=$(sed -n "${k}p" "$i.s" | cut - -f3)
		resS=$(sed -n "${k}p" "$i.s" | cut - -f5)
		num=$(echo $i | cut -d "-" - -f5)
		conc=$(echo $i | cut -d "-" - -f3)
		echo $num','$conc','$rt','$rtS','$res','$resS >> "$order.$name.csv"
	done
done

$ echo hello | md5sum | cut -f 1 | wc -c
36
Дано това не те бърка нещо.

Защо ви е да се тормозите с многократно изпълнение на команди върху набор от файлове, само ще си отровите живота в някой частен случай в който нов файл се появява докато се изпълняват командите.

Защо ви е да се тормозите с регулярни изрази след като форматът не е толкова детерминиран и горе в хедъра на репорта не е сигурно че няма да ви излязат търсените низове, за които ровите долу в показанията? После вероятно не е и известен, например не е ясно какво бълва апарата ако има грешка при вземане на пробата.

Затва най-добре един скрипт дето изчита рекурсивно всички текстови файлове в една директория и поддиректориите и и парсване ред по ред, с някакво елементарно пазене на състояние (дали сме във хедъра, дали сме в измерванията), проверки за валидност накрая (дали определени полета имат стойност) и генериране на csv реда в рамките на едно обхождане на файла, не на няколко такива. Това не би трябвало да е особено сложно.

Това на какъв език е?

function D=conv_fn(fn)
a=fscanf(fopen(fn),'%c'); D=[]; nl=10;%LF
a=a(strfind(a,'Qvalue')+7:strfind(a,'9)')+find(uint8(a(strfind(a,'9)'):end))==nl,1)-1);
while ~isempty(a)
    p=find(uint8(a)==nl,1);
    D=[D;sscanf(a(strfind(a,'.')-2:p),'%f%f%f%f%*s%f')'];
    a=a(p+1:end);
end
fclose('all');