А, може си. Защо да не може?

Основното, което е нужно за работата на системата (ядрото, някои библиотеки и основни конфигурационни файлове) стоят заредени в RAM-та, така че замяната им (то ядрото няма да се заменя, а ще се добави новото) няма да срине системата. След като качиш 64 битовите, ако не пропуснеш нещо, системата ще запали след рестарта, а ако си се справил и със замяната на останалите пакети, които активно използваш, току виж системата зареди в подобно състояние, каквото и преди замяната. Имайки предвид пипкавостта на упражнението, това е малко вероятно, но все пак...
Имаш вариант и да направиш замяната от LiveCD, вместо директно от заредената инсталирана система, което се явява по-сигурен начин, тъй като се елиминира вероятността нещо нужно на заменяната система да излезе междувременно от RAM-та и да не може да се зареди същото.
Но на практика тази гимнастика има смисъл да се прави само от ентусиазъм и интерес да се види какво ще стане, тъй като не е като да няма какво да се обърка в процеса на замяна, а преинсталацията не е задължително да води до започване от нулата, така че преинсталацията да се окаже много по-лесният избор.
Щом /root и /home са ти на отделни дялове, значи, ако си използвал само пакетния мениджър за инсталация на пакети (ако имаш такъв), остава да направиш резервно копие на /etc, да си извлечеш списък от инсталираните пакети, за да можеш после по-лесно да ги инсталираш отново след преинсталацията, и да направиш резервно копие на нужни файлове, които са извън досега споменатите дялове и папки (примери като /var/lib/mysql, където може да са ти базите на MySQL, или /var/www, където може да са ти сайтовете, и т.н., би трябвало да знаеш къде имаш подобни файлове, ако ползваш разни сървъри). След това преинсталираш системата, създаваш си същите потребители и групи (можеш да ги видиш в резервното копие на /etc), инсталираш допълнителните пакети от извлечения списък, възстановяваш от резервното копие нужните настройки от /etc, бази данни и такива неща, и общо взето си готов. Ще остане само да си компилираш наново пакетите, които не си качвал с пакетния мениджър.
Ето пример колко лесна може да е миграцията с преинсталация в дистрибуция, в която се ползва dpkg:
1. Изпълняваш "dpkg --get-selections > /root/installed_packages", за да запазиш списък на инсталираните пакети (може да смениш името на файла и пътя, където да се запази);
2. Правиш резервно копие на нужните файлове (не забравяй файла от т.1, ако не е на дял, който няма да се пипа);
3. Инсталираш 64 битовата система;
4. Възстановяваш нужните файлове от резервното копие;
5. Изпълняваш "dpkg --set-selections < /root/installed_packages", след което изпълняваш "dselect", за да инсталираш програмите от запазения списък.
Препоръчвам ти подобен алгоритъм за миграция с преинсталация, вместо несигурните операции по замяна без преинсталация, след които е възможно в системата да остане и доста боклук от предишното състояние на системата. Все пак, ако решиш да заменяш без преинсталация, по-добре потренирай в една виртуална машина, като си подготвиш максимално подобна среда