Не би трябвало да имаш проблеми да изтриеш съдържанието на tmp.
Ако искаш изцяло да триеш, без да гледаш, то го прави на init level 1 или при рестартиране.
За директории /tmp/.X11-unix и /tmp/.ICE-unix, хмм, май X-Windows от X.org не ги създаве, ако ги няма (бъг ? или !

'>.
Има системи, на които tmp е в паметта и естествено при рестартиране е празна.
Ако една програма след стартиране на OS. разчита на запазени файлове в /tmp, то тя не става за нищо.