Аз ползвам интернет банкиране на Първа инвестиционна и на Пощенска. И двете изискваха ЗАДЪЛЖИТЕЛНО първи логин в системата (за изтегляне на сертификата) с експлодер. После export-нах сертификата на едно USB стикче и ги import-вах в Firefox под линукс. Нямам проблеми с работата с тези две банки.
Принципно нищо сложно - ако имаш трудности, обади се на съответния съпорт (не може да няма) и попитай как да преместиш сертификата на друг компютър, след това просто го импортирай на линукс машината

'>