не можеш да инсталираш едно приложение два пъти. през терминал или през synaptic - първия път го инсталираш, а втория - преинсталираш. нещата ще ги омажеш, със сигурност, поне още няколко пъти - няма систем рестор! има ремастерсис! когато инсталираш unity-tweak-tool няма да видиш промяна. това е инструмент, с който Ти можеш да промениш нещата в графичен режим. всяка промяна, която правиш с този графичен инструмент може да бъде напрaвена в терминал и с gedit, например.
и кой стари икони не са се възстановили? къде? какви архиви и на кое са останали? опитай да бъдеш точна и конкретна, защото иначе никой и за нищо не може да ти помогне!
инсталирай Мате, както по-горе съм ти показал /с три команди в терминал се прави/, на логин скрийн избери сесия на Mate и си гледай кефа!
направи това, а после задавай въпросите си, но един по един и конкретно! всеки ще ти помогне, ако си попитала както трябва.
п.с. не бързай и не прави нищо "в трескаво отчаяние"

най-вероятно това, което смяташ за "голем проблем" да не е никакъв проблем
просто не бързай и първо попитай!