За деинсталирането, както и за инсталирането, на компилирани програми също трябват Makefile. След като е изтрит програмния код, в общия случай не може да се разархивира и конфигурира наново - просто защото най-вероятно е изтрит и друг програмен код, от който зависи текущия пакет.
Обърнете внимание, че след .../configure в build_dir се създава файла config.status - това е ключа! Преди да изтриете програмния код и т.н. запазете го! После след разархивиране на кода стартирайте запазения скрипт. Конкретно в случая, дори не е нужно да го пазим със същото име. Може да запазим, например, като <package>-<version>-config.status, с подходящи стойности за <package> и <version>. Скрипта ще създаде наново Makefile-овете ( и др. ) - следва make uninstall.
Дискусията по тази тема, като и по темата "source vs binary пакет", ми подсказва, че търсенето на freeware надделява на open source

'> ...