Твойте права се ширят само в домашната ти папка, за пример -

това са системните файлове, ти имаш достъп само до папката 
Home, ако влезеш в нея ще видиш една папка (ако има само един потребителски акаунт на компютъра, в зависимост колко са акаунтите на компютъра, толкова папки ще видиш) с твоето потребителско има, а в нея са папките Музика, Документи и т.н. (работният ти плот също се счита за папка в домашната директория)
Ти нямаш право да копираш някоя папка или файл от домашната ти директория и да поставиш, някъде извън нея, или обратното. Всъщност това на горепосочената снимка е цялата файлова система на Linux (бележи се със знакът   
/   ), нещо като на Windows, която се намира в 
C:\\Wndows. Има потребител наречен 
Root, той е един вид администратора и никой, освен него няма достъп до системните файлове на Linux. И дефакто точно тука идва командата 
sudo, която ти иска временен достъп до администраторските права, в замяна на парола. Това е направено от съображение за сигурност, по този начин, ако ти се лепне някой вирус, той ще може да изтрие само файловете от домашната ти директория, картинки, филми и т.н. ,всички папки на програмите, като на Firefox, Skype.. и самият Linux (ядрото) седят в самата файлова система, където никой няма достъп, освен 
Root потребителя, а ако случайно този вирус използва командата 
sudo, тя мигновено ще ти поиска парола и в такъв случай от теб зависи дали да пуснеш този вирус. Точно заради това Linux е най-сигурната операционна система (вероятно има факти, които изтървам). Обикновения потребител има достъп също и до всички периферни устройства (USB-та и т.н.), на един такъв потребител едва ли му е потрябвало да се рови из системните файлове на Linux, но ако все пак има желанието, нещата стават по следния начин. В терминалът се напише 
gksu и се появява това  -

в полето се изписва името на програмата, която искаш да стартираш като супер потребител, например 
nautilus, това е файловия мениджър, веднъж отворил си го по този начин, ти ще имаш достъп до цялата файлова система, ще можеш да триеш файлове и директории и съответно да създаваш такива. Ако искаш можеш просто да напишеш 
sudo nautilus или 
gksu nautilus в терминала и ще се получи същото. Ако искаш да промениш правата на даден файл или папка, трябва да влезеш като 
Root в 
nautilus и да щракнеш с десен бутон на мишката върху дадения обект и след това 
Свойства > Права, ето как изглежда -

и навсякъде където пише 
Root го променяш с твоето потребителско име, по този начин файлът вече става твое притежание.
Надявам се това да е било полезно и ако имаш въпроси, питай!